MST group | Cox2 | Cox5 | Cox18 | Cox20 | Cox22 | Cox37 | Cox51 | Cox56 | Cox57 | Cox61 |  |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 5 | 6 | 3 | 4 | 6 | 5 | 8 | 1 | 5 | 6 | |
| 2 | 5 | 6 | 3 | 5 | 6 | 5 | 8 | 1 | 5 | 6 | |
| 3 | 5 | 6 | 3 | 4 | 6 | 7 | 8 | 1 | 5 | 6 | |
| 4 | 5 | 6 | 3 | 2 | 6 | 5 | 8 | 1 | 5 | 6 | |
| 5 | 4 | 6 | 3 | 5 | 6 | 2 | 8 | 2 | 5 | 6 | |
| 6 | 4 | 3 | 3 | 5 | 6 | 5 | 8 | 2 | 5 | 6 | |
| 7 | 4 | 6 | 3 | 5 | 6 | 5 | 8 | 2 | 5 | 6 | |
| 8 | 5 | 4 | 2 | 5 | 1 | 5 | 3 | 3 | 4 | 4 | |
| 9 | 1 | 4 | 2 | 5 | 1 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 10 | 5 | 4 | 2 | 5 | 1 | 5 | 2 | 3 | 2 | 6 | |
| 11 | 6 | 5 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | 2 | |
| 12 | 3 | 5 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | 2 | |
| 13 | 3 | 5 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 5 | 3 | 2 | |
| 15 | 7 | 5 | 1 | 6 | 5 | 6 | 9 | 4 | 3 | 2 | |
| 16 | 3 | 8 | 5 | 3 | 4 | 1 | 6 | 7 | 6 | 5 | |
| 17 | 3 | 8 | 5 | 7 | 4 | 1 | 10 | 8 | 6 | 7 | |
| 18 | 3 | 8 | 1 | 6 | 3 | 4 | 7 | 9 | 6 | 3 | |
| 19 | 3 | 7 | 7 | 8 | 5 | 4 | 11 | 7 | 6 | 5 | |
| 20 | 3 | 2 | 6 | 1 | 5 | 4 | 4 | 10 | 6 | 5 | |
| 21 | 2 | 1 | 4 | 6 | 2 | 3 | 1 | 11 | 1 | 1 | |
| 22 | 3 | 8 | 1 | 6 | 3 | 8 | 7 | 9 | 6 | 8 | |
| 23 | 3 | 8 | 1 | 6 | 3 | 8 | 7 | 9 | 6 | 3 | |
| 24 | 3 | 5 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 12 | 3 | 9 | |
| 25 | 3 | 8 | 1 | 6 | 3 | 4 | 7 | 9 | 7 | 3 | |
| 27 | 8 | 4 | 8 | 5 | 7 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 28 | 8 | 4 | 9 | 5 | 7 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 29 | 3 | 8 | 1 | 6 | 3 | 8 | 7 | 1 | 6 | 3 | |
| 30 | 5 | 6 | 10 | 5 | 6 | 5 | 8 | 13 | 9 | 6 | |
| 31 | 9 | 4 | 9 | 5 | 8 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 32 | 3 | 5 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 12 | 3 | 2 | |
| 33 | 7 | 5 | 1 | 6 | 5 | 9 | 9 | 4 | 3 | 2 | |
| 35 | 3 | 8 | 6 | ||||||||
| 36 | 5 | 6 | 8 | ||||||||
| 37 | 6 | 5 | 3 | 5 | 6 | 5 | 8 | 2 | 5 | 6 | |
| 38 | 3 | 4 | 2 | 5 | 1 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | |
| 39 | 3 | 5 | 2 | 6 | 5 | 4 | 5 | 12 | 3 | 2 | |
| 40 | 6 | 5 | 3 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | 2 | |
| 41 | 5 | 4 | 3 | 4 | 6 | 5 | 8 | 1 | 5 | 6 | |
| 42 | 5 | 4 | 1 | 5 | 8 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 43 | 5 | 4 | 1 | 5 | 1 | 5 | 3 | 3 | 4 | 4 | |
| 44 | 7 | 5 | 3 | 6 | 5 | 9 | 9 | 4 | 3 | 4 | |
| 45 | 5 | 6 | 1 | 5 | 6 | 5 | 8 | 1 | 5 | 6 | |
| 46 | 7 | 5 | 2 | 4 | 5 | 9 | 9 | 4 | 3 | 2 | |
| 47 | 3 | 5 | 9 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | 2 | |
| 48 | 5 | 4 | 6 | 5 | 1 | 5 | 3 | 3 | 4 | 4 | |
| 49 | 3 | 7 | 2 | 6 | 5 | 4 | 11 | 7 | 6 | 5 | |
| 50 | 5 | 4 | 2 | 5 | 1 | 7 | 3 | 3 | 4 | ||
| 51 | 5 | 4 | 1 | 5 | 8 | 5 | 2 | 3 | 4 | 2 | |
| 53 | 5 | 4 | 2 | 5 | 1 | 7 | 3 | 3 | 4 | 6 | |
| 54 | 5 | 4 | 9 | 5 | 8 | 5 | 2 | 4 | 3 | 6 | |
| 55 | 5 | 4 | 9 | 5 | 8 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 57 | 4 | 6 | 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 6 | |||
| 58 | 4 | 8 | 2 | ||||||||
| 59 | 4 | 9 | 3 | ||||||||
| 60 | 10 | 10 | 11 | 10 | 6 | 4 | 12 | 14 | 10 | 10 | |
| 61 | 3 | 2 | 6 | 1 | 5 | 10 | 4 | 10 | 6 | 5 | |
| 62 | 3 | 8 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 6 | 11 | |
| 63 | 3 | 11 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 6 | 11 | |
| 64 | 3 | 8 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 9 | 6 | 11 | |
| 65 | 3 | 8 | 1 | 6 | 5 | 4 | 5 | 15 | 6 | 11 | |
| 66 | 5 | 4 | 9 | 5 | 8 | 13 | 15 | 16 | 11 | 6 | |
| 67 | 5 | 4 | 9 | 5 | 9 | 11 | 14 | 19 | 11 | 6 | |
| 68 | 5 | 4 | 9 | 5 | 8 | 11 | 15 | 16 | 11 | 6 | |
| 69 | 5 | 4 | 9 | 5 | 8 | 12 | 14 | 16 | 11 | 6 | |
| 70 | 5 | 4 | 9 | 5 | 10 | 11 | 14 | 16 | 11 | 6 | |
| 71 | 11 | 12 | 12 | 5 | 11 | 5 | 16 | 17 | 12 | 6 | |
| 72 | 8 | 13 | 12 | 5 | 6 | 5 | 8 | 18 | 5 | 13 | |
| 73 | 3 | 6 | 8 | 11 | 6 | 14 | 17 | 20 | 13 | 6 | |
| 74 | 3 | 2 | 5 | 10 | 10 | 5 | |||||
| 75 | 3 | 14 | 6 | 6 | 5 | 4 | 10 | 21 | 14 | 5 | |
| 76 | 3 | 14 | 6 | 6 | 5 | 4 | 10 | 22 | 14 | 5 | |
| 77 | 5 | 4 | 9 | 5 | 8 | 5 | 14 | 3 | 4 | 6 | |
| 78 | 3 | 2 | 6 | 1 | 5 | 4 | 4 | 10 | 15 | 5 | |
| 79 | 5 | 4 | 2 | 5 | 1 | 5 | 3 | 2 | 4 | 4 | |
| 80 | 5 | 4 | 8 | 5 | 8 | 5 | 2 | 3 | 4 | 6 | |
| 81 | 3 | 5 | 5 | 5 | 1 | 6 | 5 | ||||
| 82 | 3 | 8 | 1 | 6 | 3 | 4 | 10 | 9 | 6 | 3 | |
| 83 | 12 | 11 | 13 | 6 | 5 | 4 | 5 | 4 | 6 | 3 | |
| 84 | 3 | 8 | 1 | 6 | 5 | 4 | 13 | 9 | 6 | 11 | |
| 85 | 8 | 4 | 9 | 5 | 7 | 5 | 2 | 3 | 11 | 6 |
Concatenation of spacers for each MST group
>MST1
ATGTTTAGAACAAAATCAGTTAAGGAAACAGATGTAAATAAAGAATTGGATTTTGAGCCCATTGCTTCTTTCACTAAGTAATAATTTACTTTAAAAATTTTTTATTGACCGCTTAAATACTCTAAATAATTTTATATTTCAGCAATTCTAATTTTGACTCTTACAGTTCCGTTATTCCCGCGCAGGCGGGAATGACGAACTTAAAATTAGAATTACTGCCTTTTTTGGTTTCTTTACATTGCAAGAAAGATTAGATAAAATAAATACTTATAATTAAGGAAGATTTAACGTTTCGAAAACCTAGAAAGGCGAGCAGCCATGGGAACGAATCAAACGAAACAGAGAGAAACTCAACCAAAACGCTCTCCGAGGTGTTTGGTGTGTTGAATAAATATTTTAGATAATGATGATGTGAGTTTGTTCTAGTAATTTCGCAGTGATATGCTTAACATAAGCACGTATTGTCCCTCTCCCCCTCGAGGAGAGGGTTAAGGAGAGGGGTTTTAAAGAACCTAACTGCTGCGGTTTTTTACCCTCTCCTAGCCTCTCCCGCAGGCGGGAGGGGAATAGCGGAAGGAGGCATTGAGGATTTATACAACTCCTTTTTAGTGCCATCCAAGTTCTTTTTTCTGAAACACTATCAAGGTTGGGGTCGATATGTTAACAACACGATTAAAAATTATTCTTTCAATCATCTCGCTTTCTTTGTTGTGGCATTGACGAAGTTTTGAAGAGGGGAGCGCGGTAGTTATACCCCTATCAAAAATTTAAAGCCCGTCATTCCGCGCAGACGCATAGGCGTCAACTTAAAGAGAGCGAGGTAAAGAGGCAATATCAACCGTGACTTCGGCCGTGAAGGTTTTGTATGCTTCAATACTACAGCAGACGGCCTCGCGGGAGGACGACGGGTTTTAAGTTTTTCACGCTTCACCATGGGTGGGTAATATTAGGATCCGTGGTAAGCTTTGAAAGGAGCAAGGCGAAAGAGGGCATCAACTTACAGTCATTAGAGTTTTATGCTTAAGTTGGCGCTTCTGTGATTGTGTTGGAATAACGAAGGCCAAAAAAGGGAGGCGCTGGGAGTTTTTACTACCCTTACTTGATTTAAACCGAGACATCTTTTTAAAGCACTATTAATTTTTGGGGAACTTAATGCGGCAAATCGTTTTAGATACGGAAACCACCGGCCTTGTGCCGGAAGAAATAATAGCAGCTATAGGCATTAAAGTCCCGTTAAACAAATGACCCGCTATTGCGATAACTGCCGAAGATAGCGCCAATCGAAATGGTGCCCAGTAGGGCAGAAGACGTTCCCCTGACTTCGGGATGGGTATTCAAGGCTTGTGAGATAAACGGCCCTAATGCAATCGCTGAACCTGCCGCAAAGAGGGACATTACCGCCGTAATTAAATTGGGGCTGTTAGGTAATATGAAGTGGGATGACAACAGTAATACGGCGGCTAGCGATACGATAAATAATCCAATACGTTGGGAGGCTTGTATAGAAAATCGCTTCAGCATATAAGCAGCGATAAAGCTAAACGCCAAAAACGTCAACATAATGATTGCTTCATAATAACCTACCTGATGCTGGGTTACTCCAAGATGGTTAACAAAGAGTAAGGATAAATTAGCAATATATACAATGATGCCTGCGTACATCAAACAAGGAATCGTACCTAAAAAATAATGAATTTTTTATCTCGTAGTAAATAGAAATAGGATTGAATCATGTTTTTTAACTTTACTGCCCCCCCTGCATGTTTATATTTTTTAGGCTCTTTAAAAATGAGGTTTAGAATCAACGACAGTGGGTGAATAGATTACGCCTTCCATTATTGATTTATTGCCAAGAGGGGTGCTGTCGGGTGGTGCTCCCCTGTAGTGCGGAGAAAATATTGAACGACAATTACATAAGGCGTTAAACCACTGTATTCGTTGTTGTTGATTCATAATCGTATTCCTCAGCTATCACTCACTTTTTGCTTAGCGCTAACCATTAACAATGTCTATATTTTACACAGATCCAGGTTCGGTTTGAAGGACTGGTTTGTCGTATTTCGCTCGCGTATGGGCTGCCATTTATGCGCTCGCTTCTGAATCGACAGAGTCTAGTGTATTGGCTTGATGAAACTTTACAGCTTGGTAGCCTTGGATTTCCTCTATTTGGGAATAGGAATTAACTTTCTGTTCATTACTTCGCATATTATTTTTCTCCAATTGAAGTTATCGCCACGGGGTTATCAGTTCCAAGGGCTCACTCAGGTATAATGTCACTAGTGTATTATCAGGAAATTTCTGGTTAAACCTTTCAAGGAGGTAAAATGAAGCTTTAGATTAAAAGCTCCCAGATAAACTTAAAGAGGGGTTAAGTCGAGTATATAAGTTGAATCCGAATTAATTTTTCACCCAGCATCATCGCTTACAATGGCGAGGTCAACATTAAAACCATGCGACAAAATACTTTCAACCAAGGCTTCTCGTCGCAATTCTGCAATGATGAGAACTAATAATATCCAGAGTCTTTAAATGGGGTTGCCAAGCTTCTTTTTCAAAAAAATTATTCGAAAAATACAGCAGCTCTCAAGTTGAGAGAATAGTGGGTTTTACTAATTTTTCATAATCTTCGTACGATAATTTAAGTAATTGTGAGTGAGTGCCGGCATTAAAAACAATTTCTTTTTCTTCGCTCAACTCTTTGGAAAGGTAAACTTTCATATCGAATAAATTGCCAAAAGGTGGCATTGCCCCTAATTCACAGCCGGGAAATCGTTCTTGAAATTCGTATTCGCTGGCTAATTCCGCTTTATGGGCTCCAGTTTTTTGTTTTAATTTATCAAAGTCGACTTTATCATCGCCCGGTAGCACCACCATTGCGAGCTTATCATCGATTTTAGCAATAACACATTTCGCTAGCTTTTTAGCAGATACGTGTGAAATTTCCGCAATTTCTTGGGCAGTATAAGCTGGAGAATGATTAATAGTGACATATTTCACTTTGTTTTTATCGAGAAATTCTTTCAATTTTTCAAGCGGCATACGAAACCTCCCGACTTATCCCGTCTCTATATAGAGAATTATAGCTCATTAGGAAAATAGCAATAACCTTGAAAAGCCCATCAGGCGTGCCTTTTCAAGGCCCCATTGACGCCTAACAGCTCCCGCATTTTGGCTTGAATCATTTCCCCACAGCTACTGTTGCAATCAGAGCTAAGACTATGTTTTTCATTATAATTTAACTCTCAACCTCTTGATCTACTTTAACTTTCAAAACTCTAACTATTCCATAATCAGAGCCGGGAGTCAAGCTTCAGCCCTGCAGCGAGGAGCCATCTTAGCTTAAGCGCTGGCGCGATTCAAATCTCCTACTCAGAATAATTCTTACTCTAAATTGCGCCTTAAAATCTTAAGTAAGGATGAATTTAAGAAGAAAAATACGGGGTTAAACTTTAGGCTTGCTCTATCGCTAATCAGTATGATATATACCTTATCTAGTATAGTAGTGCTAGTAGTGCACAATTTAGCCATGATGGGACACAAAAAAATATGAGGTGACTTGTGACAGGGTTGTTACTCCACCCGAAATTCTAAGAGGAGAGACAACCATGACGTCCAAGCTGGTCATTTCCGCGTTGGGAAAACCTGGACCGAGCACAAACTTGAAACCGAGAAATGATATTGACTTAGCCCCCAACCTCAAGCACTATAAGCCCCCTGGGCGGCCAGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCGGCAGTTCGATTCTGCCTCTGGCCACCATGAAATCAAACACTTACCAATTTTACCAGTTGATCAAAATTTGACCTTGTGGGCGTTTTGTGGAACGACAACTGTGCATCACGCTTCACCAAACTTAAACGTTGGACTACTATTACTTGTCGGATAACAAGCTTTATTTGCCGACTTAATTAGGATTATCTCTATTTAAATTACCGATTAAAATTAAAGATATCTGACTAACTGATTAGCAAATTTTAACATTTCAAAATAATACTTATAATCTATTTCCAAATCGCTATTACTTGATATTTAAGTCTAAAACAGATGATAAAAAATTAATTTAAAAATCACTAAAAAGTGACAAATTATAAAAATTGATTTTAAAAATAATTTTTACAAACTAGCACTAACGAGTATAATTTTGATAAATAATAATAAATACCGCCCAGTAGCAAATTCGGAATACCCCATTTTGCCTTTTGCTTTCACGTATCGATAAGCATCGCTTTCCAAGAATTTATTGGCATAGGAGACCTTCCCATCCTGAAACGCAAACTGATGCAACATAGCAAATCCATCAAACCAGTGCCGCAGTTTTTTATTACCTGCTTCAAACTTAGCCGGACCGTTTCGAATCAGCGTCCCAGAAAGCCATTCTGGCAATGCGCCTTCAATCGGTAACTCCGAAATGACCACTTCGTTGTTCAAGGTTGAAAAACCTAAGGAATACTTTCTATTCATAAAGATAAGATTACCACTTACCTCCGATTGAGTCGAACCCTTAGTTTTTCGTTAGTTCAAAAGATTGACATTATCGAACAAACCTAGCTATTTTAAAAACCGAAAAGGCAAAAACTGATCGCCACCCCACTCACTTTACGTAATTTAAAAAATAAGCTAAGTTCAGGCCCCCTCTCATAAAAACCGGAGGTTCAAATGCCATTATTAACCTACAAGTTTGATAGAAATTTAAATAGCGAGAAAGTTTTTCAATACACTCCGCCCCCAGAAATCAA
>MST2
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>MST3
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>MST33
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>MST79
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>MST83
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