Strain Detail
Name: CB58
Ref:
Publication:
Note:
Sample nature:
Autor:
Date: 2004-09-17
MST Group: 12
>COX2.3 atgtttagaacaaaatcagttaaggaaacagatgtaaataaagaattggattttgagcccattgcttctttcactaagtaataatttactttaaaaattttttattgaccgcttaaatactctaaataattttatatttcagcaattctaattttgactcttacagttccgtcattcccgcgcaggcgggaatgacgaacttaaaattagaattactgccttttttggtttctttacattgcaagaaagattagataaaataaatacttataattaaggaagatttaacgtttcgaaaacctagaaaggcgagcagccatgggaacgaatcaaacgaaacagagagaaactcaacc >COX5.5 aaaacgctctccgaggtgtttggtgtgttgaataaatattttagataatgatgatgtgagtttgttctagtaatttcgcagtgatatgcttaacataagcacgtattgtccctctccccctcgaggagagggttaaggagagggtttttaaagaacctaactgctgcggttttttaccctctcctagcctctcccgcaggcgggaggggaatagcggaaggaggcattgaggatttatacaactcctttttagtgccgtccaagttcttttttctgaaacactatcaaggttggggtcgatatgttaacaacacgattaaaaattattctttcaatcatctcgctttctttgtt >COX18.1 gtggcattgacgaagttttgaagaggggagtgcagtagttatacccctatcaaaaatttaaagcccgtcgttccgcgcagacgcataggcgtcaacttaaagagagcgaggtaaagaggcaatatcaagtagttgaaaaaatatccgtcgttcccgtgacttcgggcgtgaaggttttgtatgcttcaatactacagcagacggcctcgcgggaggacgacgggttttaagtttttcacgcttcaccatgggtgggtaatattaggatccgtggtaagctttgaaaggagcaaggcgaaagagggcatcaacttacagtcattagagttttatgcttaagttggcgcttctgtgattgtgttggaataacgaaggccaaaaaagggaggcgctgggagtttttactacccttacttgatttaaaccgagacatctttttaaagcactattaatttttggggaacttaatgcggcaaatcgttttagatacggaaaccaccggccttgtgccggaag >COX20.6 aaataatagcagctataggcattaaagtcccgttaaacaaatgacccgctattgcgataactgccgaagatagcgccaatcgaaatggtgcccagtagggcagaagacgttcccctgacttcgggatgggtattcaaggcttgtgagataaacggccctaatgcaatcgctgaacctgccgcaaagagggacattaccgccgtaattaaattggggctgttaggtaatatgaagtgggatgacaacagtaatacggcggctagcgatacgataaataatccaatacgttgggaggcttgtatagaaaatcgcttcagcatataagcagcgataaagctaaacgccaaaaacgtcaacataatgattgcttcataataacctacctgatgctgggttactccaagatggttaacaaagagtaaggataaattagcaatatatacaatgatgcctgcgtacatcaaacaaggaatcgtacctaaaataatgaattttttatctcgtagtaaatagaaataggattgaatcatgttttttaactttactgcccccctgcatgtttatattttttaggctctttaaaaa >COX22.5 tgaggtttagaatcaacgacagtgggtgaatagattacgccttccattattgatttattgccaagaggggtgctgtcgggtggtgctcccttgtagtgcggagaaaatattgaacgacaattacataaggcgttaaatcactgtattcgttgttgttgattcataatcgtattcctcagctatcactcactttttgcttagcgctaaccattaacaatgtctatattttacacagatccaggttcggtttgaaggactggtttgtcgtatttcgctcgcgtatgggctgccatttatgcgctcgcttctgaatcgacagagtctagtgtattggcttgatg >COX37.4 aaactttacagcttggtagccttggatttcctctatttgggaatcggaattaactttctgttcattacttcgcatattatttttctccaattgaagttatcgccacggggttatcagttccaagggctcactcaggtataatgtcactagtgtattatcaggaaatttctggttaaacctttcaaggaggtaaaatgaagctttagattaaaagctcccagataaacttaaagaggggttaagtcgagtatataagttgaatccgaattaatttttcacccagcatcatcgcttacaatggcgaggtcaacattaaaaccatgcgacaaaatactttcaaccaaggcttcttccgtcgcaattctgcaatgatgagaactaataatatccagagtctttaaatggggttgccaagcttcttt >COX51.5 ttcaaaaaaattattcgaaaaatacagcagctctcaagttgagagaatagtgggttttactaatttttcataatcttcgtacgataatttaagtaattgtgagtgagtgccggcattaaaaacaatttctttttcttcgctcaactctttggaaaggtaaactttcatatcgaataaattgccaaaaggtggcattgcccctaattcacagccgggaaatcgttcttgaaattcgtattcgctggctaattccgctttatgggctccagttttttttaatttatcaaagtcgactttatcatcgcccggtagcaccaccattgcgagcttatcatcgattttagcaataacacatttcgctagctttttagcagatacgtgtgaaatttccgcaatttcttgggcagtataagctggagaatgattaatagtgacatatttcactttgtttttatcgagaaattctttcaatttttcaagcggcatacaaaacctcccgacttatcccgtctctatatagagaattatagctcattaggaaaatagcaataaccttgaaaagcccatcaggcgtgccttttcaaggccccattgacgcctaacagctcccgcattttggcttgaatcatttc >COX56.4 cccacagctactgttgcaatcagagctaagactattttcattataatttaactctcaacctcttgatctattttaactttcaaaactctaactgttccataatcagagccgggagtcaagcttcagccctgcagcgaggagccatcttagcttaagcgctggcgcgattcaaatctcctactcagaataattcttactctaaattgcgccttaaaatcttaagtaaggatgaatttaagaagaaaaatacggggttaaactttaggcttgctctatcgctaatcagtatgatatataccttcttaattagtagtgcacaatttagccacgatgggacacaaaaaaatatgaggtgacttgtgacagggttgttactccacccgaaattctaagaggagagacaaccatgacgtccaagctggtcatttccgcgttggg >COX57.3 tggaaatggaaggcggattcaaaacctggaccgagcacaaacttgaaaccgagaaatgatattgacttagcccccaacctcaagcactataagccctctgggcggccagatagctcagtcggtagagcagaggactgaaaatcctcgtgtcggcagttcgattctgcctctggccaccatgaaatcaaacacttaccaattttaccagttggtcaaaatttggccttgtgggcgttttgtggaacgacaactgtgcatcacgcttcaccaaacttaaacgttggactactattacttgtcggataacaagctttatttgccgacttgattaggattatctctatttaaattaccgattaaaattaaagatatctgactaactgattagcaaattttaacatttcaaaataatacttataatctatttccaaatcgctattacttgatatttaagtctaaaacagatgataaaaaattaatttaaaaatcactaaaaagtgacaaattataaaaattgattttaaaaataatttttacaaactagcactaacgagtataattttgataaataataataaataccgccaaaggcttacgccttccacc >COX61.2 cagtagcaaattcggaataccccattttgccttttgctttcacgtatcgataagcatcgctttccaagaatttattggcataggagacctttccatcctaaaacgcaaactgatgcaacatagcaaatccatcaaaccagtgccgcagttttttattacctgcttcaaacttagctggaccgtttcgaatcagcgtcccagaaagtcattctggcaatgcgcctttaatcggtaactccgaaatgaccacttcgttgttcaaggttgaaaaacctaaggaatactttctattcataaagataagattaccacttacctccgattgagtcgaacccttagtttttcgttagttcaaaagattgacattatcgaacaaacctagctattttaaaaaccgaaaaggcaaaaactgatcgccaccccacttactttacgtaatttaaaaaataagctaagtttaggccccctctcataaaaaccggaggttcaaatgccattattaacctacaagtttgatagaaatttaaatagcgagaaagtttttcaatacactccgcccccagaaatcaa
>COX2.3+COX5.5+COX18.1+COX20.6+COX22.5+COX37.4+COX51.5+COX56.4+COX57.3+COX61.2 atgtttagaacaaaatcagttaaggaaacagatgtaaataaagaattggattttgagcccattgcttctttcactaagtaataatttactttaaaaattttttattgaccgcttaaatactctaaataattttatatttcagcaattctaattttgactcttacagttccgtcattcccgcgcaggcgggaatgacgaacttaaaattagaattactgccttttttggtttctttacattgcaagaaagattagataaaataaatacttataattaaggaagatttaacgtttcgaaaacctagaaaggcgagcagccatgggaacgaatcaaacgaaacagagagaaactcaaccaaaacgctctccgaggtgtttggtgtgttgaataaatattttagataatgatgatgtgagtttgttctagtaatttcgcagtgatatgcttaacataagcacgtattgtccctctccccctcgaggagagggttaaggagagggtttttaaagaacctaactgctgcggttttttaccctctcctagcctctcccgcaggcgggaggggaatagcggaaggaggcattgaggatttatacaactcctttttagtgccgtccaagttcttttttctgaaacactatcaaggttggggtcgatatgttaacaacacgattaaaaattattctttcaatcatctcgctttctttgttgtggcattgacgaagttttgaagaggggagtgcagtagttatacccctatcaaaaatttaaagcccgtcgttccgcgcagacgcataggcgtcaacttaaagagagcgaggtaaagaggcaatatcaagtagttgaaaaaatatccgtcgttcccgtgacttcgggcgtgaaggttttgtatgcttcaatactacagcagacggcctcgcgggaggacgacgggttttaagtttttcacgcttcaccatgggtgggtaatattaggatccgtggtaagctttgaaaggagcaaggcgaaagagggcatcaacttacagtcattagagttttatgcttaagttggcgcttctgtgattgtgttggaataacgaaggccaaaaaagggaggcgctgggagtttttactacccttacttgatttaaaccgagacatctttttaaagcactattaatttttggggaacttaatgcggcaaatcgttttagatacggaaaccaccggccttgtgccggaagaaataatagcagctataggcattaaagtcccgttaaacaaatgacccgctattgcgataactgccgaagatagcgccaatcgaaatggtgcccagtagggcagaagacgttcccctgacttcgggatgggtattcaaggcttgtgagataaacggccctaatgcaatcgctgaacctgccgcaaagagggacattaccgccgtaattaaattggggctgttaggtaatatgaagtgggatgacaacagtaatacggcggctagcgatacgataaataatccaatacgttgggaggcttgtatagaaaatcgcttcagcatataagcagcgataaagctaaacgccaaaaacgtcaacataatgattgcttcataataacctacctgatgctgggttactccaagatggttaacaaagagtaaggataaattagcaatatatacaatgatgcctgcgtacatcaaacaaggaatcgtacctaaaataatgaattttttatctcgtagtaaatagaaataggattgaatcatgttttttaactttactgcccccctgcatgtttatattttttaggctctttaaaaatgaggtttagaatcaacgacagtgggtgaatagattacgccttccattattgatttattgccaagaggggtgctgtcgggtggtgctcccttgtagtgcggagaaaatattgaacgacaattacataaggcgttaaatcactgtattcgttgttgttgattcataatcgtattcctcagctatcactcactttttgcttagcgctaaccattaacaatgtctatattttacacagatccaggttcggtttgaaggactggtttgtcgtatttcgctcgcgtatgggctgccatttatgcgctcgcttctgaatcgacagagtctagtgtattggcttgatgaaactttacagcttggtagccttggatttcctctatttgggaatcggaattaactttctgttcattacttcgcatattatttttctccaattgaagttatcgccacggggttatcagttccaagggctcactcaggtataatgtcactagtgtattatcaggaaatttctggttaaacctttcaaggaggtaaaatgaagctttagattaaaagctcccagataaacttaaagaggggttaagtcgagtatataagttgaatccgaattaatttttcacccagcatcatcgcttacaatggcgaggtcaacattaaaaccatgcgacaaaatactttcaaccaaggcttcttccgtcgcaattctgcaatgatgagaactaataatatccagagtctttaaatggggttgccaagcttctttttcaaaaaaattattcgaaaaatacagcagctctcaagttgagagaatagtgggttttactaatttttcataatcttcgtacgataatttaagtaattgtgagtgagtgccggcattaaaaacaatttctttttcttcgctcaactctttggaaaggtaaactttcatatcgaataaattgccaaaaggtggcattgcccctaattcacagccgggaaatcgttcttgaaattcgtattcgctggctaattccgctttatgggctccagttttttttaatttatcaaagtcgactttatcatcgcccggtagcaccaccattgcgagcttatcatcgattttagcaataacacatttcgctagctttttagcagatacgtgtgaaatttccgcaatttcttgggcagtataagctggagaatgattaatagtgacatatttcactttgtttttatcgagaaattctttcaatttttcaagcggcatacaaaacctcccgacttatcccgtctctatatagagaattatagctcattaggaaaatagcaataaccttgaaaagcccatcaggcgtgccttttcaaggccccattgacgcctaacagctcccgcattttggcttgaatcatttccccacagctactgttgcaatcagagctaagactattttcattataatttaactctcaacctcttgatctattttaactttcaaaactctaactgttccataatcagagccgggagtcaagcttcagccctgcagcgaggagccatcttagcttaagcgctggcgcgattcaaatctcctactcagaataattcttactctaaattgcgccttaaaatcttaagtaaggatgaatttaagaagaaaaatacggggttaaactttaggcttgctctatcgctaatcagtatgatatataccttcttaattagtagtgcacaatttagccacgatgggacacaaaaaaatatgaggtgacttgtgacagggttgttactccacccgaaattctaagaggagagacaaccatgacgtccaagctggtcatttccgcgttgggtggaaatggaaggcggattcaaaacctggaccgagcacaaacttgaaaccgagaaatgatattgacttagcccccaacctcaagcactataagccctctgggcggccagatagctcagtcggtagagcagaggactgaaaatcctcgtgtcggcagttcgattctgcctctggccaccatgaaatcaaacacttaccaattttaccagttggtcaaaatttggccttgtgggcgttttgtggaacgacaactgtgcatcacgcttcaccaaacttaaacgttggactactattacttgtcggataacaagctttatttgccgacttgattaggattatctctatttaaattaccgattaaaattaaagatatctgactaactgattagcaaattttaacatttcaaaataatacttataatctatttccaaatcgctattacttgatatttaagtctaaaacagatgataaaaaattaatttaaaaatcactaaaaagtgacaaattataaaaattgattttaaaaataatttttacaaactagcactaacgagtataattttgataaataataataaataccgccaaaggcttacgccttccacccagtagcaaattcggaataccccattttgccttttgctttcacgtatcgataagcatcgctttccaagaatttattggcataggagacctttccatcctaaaacgcaaactgatgcaacatagcaaatccatcaaaccagtgccgcagttttttattacctgcttcaaacttagctggaccgtttcgaatcagcgtcccagaaagtcattctggcaatgcgcctttaatcggtaactccgaaatgaccacttcgttgttcaaggttgaaaaacctaaggaatactttctattcataaagataagattaccacttacctccgattgagtcgaacccttagtttttcgttagttcaaaagattgacattatcgaacaaacctagctattttaaaaaccgaaaaggcaaaaactgatcgccaccccacttactttacgtaatttaaaaaataagctaagtttaggccccctctcataaaaaccggaggttcaaatgccattattaacctacaagtttgatagaaatttaaatagcgagaaagtttttcaatacactccgcccccagaaatcaa
Edit | Back
Multi Spacers Typing - Coxiella